С 1986 года директор-распорядитель театра Ленком.
Марк Борисович Варшавер стоял во главе легендарных проектов Ленкома: «Поминальная молитва», «Шут Балакирев», «Варвар и еретик», «Мудрец», «Безумный день, или Женитьба Фигаро», «Плач палача», «Ва-банк», «Тартюф», «Вишневый сад», «Женитьба», «Укрощение укротителей», «Tout paye, или Всё оплачено», «Пролетая над гнездом кукушки (Затмение) и многих других.
Лауреат Первой театральной премии России «Хрустальная Турандот» (2016) за долголетнее служение театру, безупречную организацию театрального процесса. Почти сорок лет М.Б. Варшавер у руля одного из самых популярных и успешных театров России.
Возрождение легендарного спектакля Марка Захарова «Поминальная молитва» на сцене Ленкома по инициатеве Марка Борисовича стало важной вехой в театральной жизни страны.

«Марк Борисович очень уверенно занимает свой пост и добивается того, чтобы в нашем театре все было на 100–150%, и мы все очень благодарны ему за это»
Александр Збруев, народный артист РСФСР